两厢汽车和三厢的汽车的区别是：1、结构不同：两厢车的驾驶室和后备厢为同一个厢体且发动机独立布置；三厢汽车由三个相互封闭用途各异的“厢”所组成，分别为前部的发动机舱、车身中部的乘员舱和后部的行李舱。2、车型不同：两厢汽车应用于小型车和紧凑型车；三厢汽车应用于大中型轿车及车型。3、特点不同：两厢车的后车门宽敞，使用灵活、用途广泛，具有良好的正面碰撞保护性能；三厢汽车中间高两头低，从侧面看前后对称，车身尺寸长。